生物相容性对于组织工程支架的构建是必不可少的。在研究组织工程生物纤维素支架构建中，体内生物相容性的评价非常重要。Helenius等系统地研究了生物纤维素的体内相容性。实验中他们将生物纤维素植入老鼠体内1-12周，利用组织免疫学和电子显微镜技术，从慢性炎症反应、异物排斥反应以及细胞向内生长和血管生成等方面的特征来评价植入物的体内相容性。结果发现植入物周围无肉眼和显微镜可见的炎症反应，没有纤维化被膜和巨细胞生成。生物纤维素被成纤维细胞侵入，与宿主组织融为一体，未引起任何慢性炎症反应。因此可以断定生物纤维素的生物相容性非常好，在组织工程支架构建方面具有潜在价值。